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Polysome Profiling—解析翻译调控机制的金标准

2025年12月03日 15:31:14 人气: 707 来源: 蓝景科信河北生物科技有限公司

蛋白质是生物体内各项生命活动的主要执行者,蛋白质的合成、修饰、折叠和组装受到精密调控。根据中心法则,遗传信息从DNA经由mRNA传递到蛋白质。这个过程主要受到四个水平的精密调控:转录调控、转录后调控、翻译调控和翻译后调控。翻译调控的幅度和强度超过了转录、mRNA降解和蛋白质降解的总和。因此,在翻译组水平研究RNA的翻译事件至关重要。翻译组研究能够直接捕捉正在被核糖体翻译的mRNA,揭示基因表达在翻译层面的动态变化,包括翻译起始、延伸速率及潜在的非经典翻译事件。

此外,越来越多的证据表明,长非编码RNA(IncRNA)、环状RNA(circRNA)等非编码RNA也可能存在翻译活性,产生功能性微蛋白,这进一步凸显了翻译组学研究的重要性。结合转录组、蛋白组及表观转录组(如m6A修饰)数据,翻译组分析有助于构建更完整的基因表达图谱。因此,开展翻译组研究不仅是对传统中心法则的深化,更是解析复杂生命活动的一环。

翻译组学的研究技术有多聚核糖体图谱分析(Polysomeprofiling)、核糖体新生链复合物测序(RNC-seq)、翻译核糖体亲和纯化测序(TRAP-seq)和核糖体印迹测序(Ribosomeprofiling,又称为Ribo-seq)。Polysomeprofiling利用核糖体沉降系数较大的特性分离多聚核糖体,是经典的翻译组检测技术,是评估翻译效率的“金标准”。

Polysomeprofiling是基于蔗糖密度梯度离心,将细胞质RNA分离成多个组分:游离RNA,结合核糖体40S或60S亚基、单核糖体(80S)或多聚核糖体等。一条正在翻译的mRNA可同时结合多个核糖体,结合核糖体组分的RNA与胞质总RNA的比例可以直接反映翻译水平。后续可以分别收集40S、60S、80S和多聚核糖体,用于RNA或蛋白质分析,也可以通过酶消化检测disome。

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送样要求


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样本的保存和运输

液氮速冻。-80℃保存,干冰运输

01量化翻译效率

Polysome profiling可精确分离核糖体亚基、单核糖体及多核糖体组分

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Polysome profiling分离组分可用于分析样品整体翻译活性,计算翻译效率(TE)。

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02解析翻译调控机制

Polysomeprofiling可作为Disome/Trisome-seq等技术的预检测环节。在酶切后进行Polysomeprofiling分析,通过发现disome或trisome的变化来检测核糖体碰撞(collision)与翻译停滞(stalling)现象。

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03捕捉翻译活性动态变化

Polysomeprofiling体现RNA在各组分中的分布变化,可捕捉药物处理、应激、病理等条件下的翻译活性的动态变化。

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04 多维整合验证

Polysomeprofiling下游产物可进行多种检测:高通量测序分析全局翻译状态;RT-qPCR验证不同条件下特定基因的翻译状态;WB/质谱验证翻译活性,还可分析翻译调控因子的功能。

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05 新颖翻译事件挖掘

Polysome profiling可以挖掘潜在可翻译的ncRNA

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关键词: polysome profiling
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