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DAP-seq助力揭示多年生黑麦草LpMYBR1调控叶色的分子机制

2026年07月23日 14:31:11 人气: 35 来源: 蓝景科信河北生物科技有限公司


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文献题目:LpMPK6 regulates leaf color in perennial ryegrass by inhibiting LpMYBR1-modulated transcription of LpNRT1.5

发表期刊:Journal of Integrative Plant Biology

影响因子:9.3

发表时间:2026年3月12日

发表单位:西北农林科技大学

蓝景科信提供:DAP-seq技术服务

主要研究内容

草坪草叶色是评判其观赏价值与生长健康状态的核心指标,氮素是构成叶绿素的关键元素,硝态氮的吸收、转运过程显著影响草坪草叶色表型,而多年生黑麦草中氮素介导叶色调控的分子机制一直未被阐明。本研究发现,低氮/缺营养条件下,LpMPK6过表达株系叶片黄化加剧,叶绿素、总氮及硝态氮含量降低,RNAi株系则保持绿叶、氮素与叶绿素含量更高,证明LpMPK6负调控黑麦草叶色与氮积累。经酵母双杂交、Pull-down、Co-IP、荧光素酶互补等实验证实,LpMPK6与转录因子LpMYBR1特异性互作,且二者功能拮抗,LpMYBR1能够改善植株在低氮环境下的叶片持绿特性。

为挖掘LpMYBR1的下游靶基因,本研究借助DAP-seq技术开展全基因组筛选,共鉴定出90001个LpMYBR1结合峰,其中8.2%位于基因启动子区域;同时预测得到6个MYB转录因子保守结合基序。对启动子区对应的靶基因进行GO功能富集分析,显著富集到6个氮素调控相关通路,并筛选出LpNRT1.5、LpNRT1.8等硝态氮转运蛋白候选基因。酵母单杂交、凝胶迁移及双荧光素酶实验证实,LpMYBR1能够直接结合LpNRT1.5启动子并激活其转录,但对LpNRT1.8无调控作用。功能验证表明,定位于细胞膜的LpNRT1.5特异性介导硝态氮从根系向地上部转运,并不参与根系对硝态氮的吸收。磷酸化实验进一步证明,LpMPK6可靶向磷酸化LpMYBR1的第18位T残基,显著削弱LpMYBR1的转录激活活性;该调控效应会抑制LpNRT1.5表达,降低硝态氮根冠转运,最终导致叶片氮素与叶绿素合成受阻,引发叶片黄化。

该研究解析了多年生黑麦草中LpMPK6-LpMYBR1-LpNRT1.5的调控通路,优化了叶色与氮素代谢的分子机理研究,对培育低氮适应性强、观赏品质优良的草坪草品种具有重要指导意义。

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图1. LpMPK6与LpMYBR1的相互作用。(A)酵母双杂交(Y2H)实验显示LpMPK6与LpMYBR1之间的相互作用。(B)荧光素酶互补成像(LCI)实验表明LpMPK6与LpMYBR1存在相互作用。(C)下拉实验显示GST-LpMPK6与His-LpMYBR1的结合关系。(D)共免疫沉淀(Co-IP)实验证实植物中LpMYBR1-GFP可与LpMPK6-Flag结合。

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图2. LpMYBR1调控LpNRT1.5的转录。(A)通过DAP-seq鉴定出的LpMYBR1结合峰在全基因组范围内的分布。(B)推定LpMYBR1靶基因的GO富集情况。(C、D)野生型、LpMYBR1过表达株及RNAi处理幼苗中15NO3-的吸收效率(C)和根-茎转运效率(D)。(E)野生型、LpMYBR1过表达株及RNAi处理幼苗中LpNRT1.5的转录水平。(F)LpNRT1.5启动子片段示意图。(G)LpMYBR1与截短启动子(pLpNRT1.5T)结合的酵母单杂交实验结果。(H)LpMYBR1与F1/F2启动子片段结合的EMSA实验结果。(I)双荧光素酶实验中使用的效应基因与报告基因构建体示意图。(J)双荧光素酶实验的代表性荧光图像。(K)LUC/REN荧光素酶活性相对值。

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关键词: DAP-seq
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